Hanteringsavgiften träder i kraft 1 november och uppgår till två euro (strax över 22 kronor) för småpaket som beställs från länder utanför den europeiska unionen.
Den nya avgiften tillkommer utöver den tillfälliga tullavgift på tre euro som infördes den 1 juli för försändelser värda under 150 euro.
Enligt organisationen är förhoppningen att tullavgiften ska styra om importen till större samlade leveranser och därmed underlätta kontrollerna.